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较多研究结果表明，低分子量壳聚糖是有效的生物源激发子，能够诱导植物防御反应并激活可提高作物对病害抗性的不同信号转导途径。目前关于植物对壳聚糖处理的响应中研究最多的是木质素、胼胝质等化学和机械屏障的形成以及参与防御反应有关物质和酶的合成。在某些情况下，壳聚糖引起的过敏反应（主要是受侵染部位），导致程序性细胞死亡。同时，这些过敏反应还伴随着植物防御机制的系统反应，这些系统反应主要包括在防御反应中起积极作用的次生代谢物的合成与积累，如木质素、胼胝质、植保素、病程相关蛋白；参与防御反应代谢途径的关键酶活性的调节，如苯丙氨酸解氨酶、过氧化物酶和几丁质酶。

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关于壳聚糖对水果类作物生长发育影响的研究最多，叶面喷施壳聚糖可促进咖啡（ＣｏｆｆｅａａｒａｂｉｃａＬ．）植株生长，也可促进智利草莓（ＦｒａｇａｒｉａｃｈｉｌｏｅｎｓｉｓＬ．）营养成长并提高产量。葡萄（ＶｉｔｉｓｖｉｎｉｆｅｒａＬ．）扦插枝条浸在壳聚糖溶液中可促进生根，增加茎节数量。在草莓植株不同发育阶段喷施壳聚糖，可增加所结果实的保质期。壳聚糖处理也可提高番茄植株产量。壳聚糖也可用来处理果实，通过包膜或浸蘸的方式延长蔬菜、水果的货架期并延缓其变质。壳聚糖在果实表面形成保护层减少水分损失、抑制气体交换、减少养分流失，并防止微生物在果实表面生长。

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最近的研究结果表明，壳聚糖可延长具有重要商业价值的热带水果如番木瓜（ＣａｒｉｃａｐａｐａｙａＬ．）、芒果（ＭａｎｇｉｆｅｒａｉｎｄｉｃａＬ．）等的贮藏期并减少其腐烂。壳聚糖处理柠檬（ＣｉｔｒｕｓｌｉｍｏｎＬ．）后，由青霉属（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍｓｐｐ．）植物病原真菌引起的柠檬青霉病发病率降低。茉莉酸甲酯与壳聚糖处理智利草莓可保持其较高的果实硬度和花色素苷含量，同时显著延缓其腐烂。壳聚糖包膜处理可延长猕猴桃的货架期。壳聚糖和肉桂醛包膜处理可增强甜瓜（ＣｕｃｕｍｉｓｍｅｌｏＬ．）结构的完整性以及抗氧化代谢。壳聚糖包膜处理可提高采后枇杷（ＥｒｉｏｂｏｔｒｙａｊａｐｏｎｉｃａＬｉｎｄｌ．）果实品质和营养品质。壳聚糖和水杨酸处理可通过提高黄瓜（ＣｕｃｕｍｉｓｓａｔｉｖｕｓＬ．）果实中的水杨酸水平和抗氧化酶活性，减轻冷储过程中黄瓜冷害的发生。

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壳聚糖作为来源广的生物聚合物，可以诱导植物产生大量生理响应，如胁迫抗性以及生产力提高，但这些生理响应是否发生，与壳聚糖的化学组成以及处理的时间和频率有关，总体来说壳聚糖在可持续农业实践以及在食品生产和保存中拥有较大发展前景，尤其是壳聚糖在替代杀菌剂等对环境存在污染的化学农药等方面具有较大的应用潜力，在有机农业中由于缺乏有效的方法控制植物病害，壳聚糖的应用前景较大。目前有机农业中植物病害的控制，特别是真菌和细菌病原物引起的植物病害，主要是使用波尔多液等铜制剂防治。然而，由于使用铜制剂存在对环境造成重金属污染的风险，因此寻找环境友好的替代物是必须的。

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Weir等1993年成功地将难以与发酵液分离的酵母用脱乙酰甲壳素进行了分离。青岛海洋大学刘万顺等将脱乙酰甲壳素作为絮凝剂用于谷氨酸发酵液菌体絮凝技术的研究，发酵液中菌体的去除率达98%以上。姜涌明等用脱乙酰甲壳素为载体，对木瓜蛋白酶、胰蛋白酶、中性蛋白酶及胃蛋白酶进行固定化，其活力回收率分别达47%、50%、74%和55%，酶的稳固性得到明显提高。利用动物细胞大规模培养技术，能够制备稀有的生化药物和细胞活性因子等产品。研究证明，脱乙酰甲壳素是一种新型的细胞大规模培养用的优质材料。陈西广等已利用其作为要紧原料制成一系列微载体，这种微载体耐高温高压，可湿热除菌。通过细胞培养实验，这种微载体能适宜来源于不同物种的细胞在其表面高密度生长。